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Coût d’une absence : postes, maintien de salaire, IJSS

Mis à jour le 1er octobre 2026 · Sources vérifiées le 1er octobre 2026

Le coût d’une absence se construit poste par poste : complément de salaire versé par l’employeur, indemnités journalières de la Sécurité sociale, remplacement, effets indirects. Cette page détaille les règles du maintien de salaire, propose un tableau de postes à tenir et distingue le coût d’une période de la trésorerie.

Le tableau de postes à tenir

Une ligne par poste, quatre informations :

le poste : maintien de salaire, remboursements (IJSS, prévoyance), remplacement, autre surcoût ;
la source : paie, DSN, facture, relevé de temps ;
le montant ;
le statut : constaté, quand une pièce le prouve, ou estimé, quand il repose sur une hypothèse écrite.

Le tableau ne contient que des totaux par période. Le solde se lit ainsi : maintien + remplacement + autres surcoûts, moins remboursements.

Maintien de salaire : les conditions

Le complément employeur (article L1226-1 du Code du travail, fiche Service Public F3053) suppose :

un an d’ancienneté, appréciée au premier jour d’absence ;
un certificat médical transmis à l’employeur sous 48 heures ;
une prise en charge par la Sécurité sociale ;
des soins en France ou dans l’Union européenne ou l’Espace économique européen ;
un salarié qui n’est ni travailleur à domicile, ni saisonnier, intermittent ou temporaire.

Le versement effectif des IJ par la Sécurité sociale n’est pas une condition : elles servent au calcul. Une convention collective ou un accord peut prévoir plus favorable, par exemple un maintien intégral.

Carence, taux et durées

Deux carences ne se confondent pas : 3 jours côté Sécurité sociale (IJ à partir du 4e jour), 7 jours côté employeur (complément à partir du 8e jour), pour chaque arrêt. En accident du travail ou maladie professionnelle, hors accident de trajet, le complément part dès le premier jour.

Le complément représente 90 % de la rémunération brute pendant 30 jours, puis deux tiers pendant 30 jours. Ces durées augmentent de 10 jours par période entière de 5 ans d’ancienneté au-delà de la première année, sans dépasser 90 jours par palier. Durées maximales :

1 à 5 ans d’ancienneté : 60 jours (30 à 90 %, puis 30 aux deux tiers) ;
6 à 10 ans : 80 jours (40 + 40) ;
11 à 15 ans : 100 jours (50 + 50) ;
16 à 20 ans : 120 jours (60 + 60) ;
21 à 25 ans : 140 jours (70 + 70) ;
26 à 30 ans : 160 jours (80 + 80) ;
31 ans et plus : 180 jours (90 + 90).

Si des périodes d’indemnisation ont eu lieu dans les 12 mois précédents, les jours déjà indemnisés sont déduits.

Montant : déductions et plafond des IJ

Le montant employeur égale 90 % puis deux tiers de la rémunération brute, après déduction des IJ et des prestations de prévoyance, pour la seule part financée par l’employeur. Si les IJ sont réduites (hospitalisation, sanction de la caisse), le calcul retient les IJ intégrales. La rémunération retenue suit l’horaire pratiqué dans l’établissement pendant l’absence, sans l’augmentation d’horaire due à l’absence elle-même.

Côté Sécurité sociale, l’IJ vaut 50 % du salaire journalier de base, plafonné à 1,4 Smic mensuel pour les arrêts débutant à compter du 1er avril 2025 (1,8 Smic auparavant), selon le décret n° 2025-160 du 20 février 2025. Pour un arrêt débuté en 2026, le plafond est de 2 613,82 euros par mois et l’IJ maximale de 42,97 euros bruts par jour. Ces paramètres suivent le Smic : à recalculer pour un arrêt d’une autre année.

Remplacement et effets indirects

Remplacement : intérim, renfort, heures supplémentaires, en retenant seulement le surcoût par rapport à ce qui aurait été dépensé sans l’absence ;
un salarié présent qui remplace dans son horaire habituel ne se valorise pas une seconde fois ;
effets indirects : temps de coordination, formation du remplaçant, retards de production, charge reportée sur les présents.

Un effet indirect entre dans le tableau avec un temps relevé, une facture ou une hypothèse écrite. Sans mesure, il reste une observation qualitative, sans coefficient appliqué au coût direct.

Coût de la période et trésorerie

Deux lectures : le coût rattaché à la période, selon les dates des absences, et les flux réellement encaissés. En subrogation, les IJ dues à l’entreprise ne sont pas versées tant que la caisse n’a pas reçu les volets 1 et 2 de l’arrêt papier ; s’ils arrivent hors délai, une réduction de 50 % à 100 % peut être appliquée.

Un retard de transmission décale donc la trésorerie et peut réduire le remboursement : voir l’actualité sur les retards d’arrêts papier.

Scénario de baisse et calculateur

Le calculateur de coût additionne maintien retenu, remplacement et autres surcoûts, retire les remboursements et affiche un solde négatif tel quel. Exemple : 1 000 euros de maintien, 500 de remplacement, 100 d’autres surcoûts, 400 de remboursement : total brut 1 600 euros, solde 1 200 euros. Avec une baisse hypothétique de 10 % des postes bruts (remboursement constant) : 1 040 euros.

Ce scénario est une hypothèse de calcul : un contrat de remplacement ou une formation comporte des coûts fixes qui ne baissent pas avec les heures. Les heures d’absence viennent de la méthode de calcul du taux.

Questions fréquentes

Le taux d’absentéisme suffit-il à calculer un coût ?

Non. Il faut les montants de la période : maintien, remboursements, remplacement. Un taux en heures ne dit ni le salaire maintenu, ni les IJ perçues, ni les dépenses de remplacement.

Le complément employeur est-il dû dès le premier jour ?

Non, sauf accident du travail ou maladie professionnelle hors trajet. Pour une maladie ordinaire, il démarre au 8e jour de chaque arrêt, sauf convention collective ou accord plus favorable.

Que retenir si les IJ sont réduites ?

Le calcul du complément retient les IJ intégrales, comme si elles avaient été versées sans réduction. Une hospitalisation ou une sanction de la caisse ne diminue donc pas les sommes déduites du complément dû.